Beşiktaş'taki ilk iki döneminde de benzer bir durum yaşayan 31 yaşındaki golcü, 2016-17 sezonunda ilk 5 maçta suskundu, 6. haftada golle tanıştı. Şampiyonluğun geldiği sezonu toplamda 12 gol, 4 asistle tamamladı.

2020-21 sezonunda da ilk 5 hafta 1 gol atıp, 1 asist yaptı. Ardından 5 karşılaşma üst üste toplam 7 golü rakip ağlara bırakarak ritmini buldu ve sezonu 15 gol, 5 asistle tamamladı.

Öte yandan Aboubakar'ın son 3 karşılaşmada çektiği 8 şutun 5'i kaleyi bulurken 3'ü golle sonuçlandı.